Делеция не выявлена что это значит

Почему не все люди болеют COVID-19? Поиск причин привел к ДНК

Делеция не выявлена что это значит

https://ria.ru/20200513/1571223570.html

Почему не все люди болеют COVID-19? Поиск причин привел к ДНК

Коронавирус ведет себя избирательно: одни страны сильно страдают от эпидемии, в других ситуация более спокойная. Многие люди переносят болезнь без симптомов, а… РИА Новости, 13.05.2020

2020-05-13T08:00

2020-05-13T08:00

2020-05-13T08:03

риа наука

коронавирус sars

коронавирус covid-19

genotek

генетика

биология

здоровье

открытия – риа наука

москва

/html/head/meta[@name='og:title']/@content

/html/head/meta[@name='og:description']/@content

https://cdn24.img.ria.ru/images/07e4/05/06/1571037864_0:183:2993:1866_1400x0_80_0_0_93dd386c594c6aebeaa25cc94b1640fa.jpg

МОСКВА, 13 мая — РИА Новости, Татьяна Пичугина. Коронавирус ведет себя избирательно: одни страны сильно страдают от эпидемии, в других ситуация более спокойная.

Многие люди переносят болезнь без симптомов, а кто-то попадает в реанимацию. Одно из объяснений — генетическая предрасположенность.

Не исключено, что в ДНК есть мутации, сдерживающие или, наоборот, облегчающие проникновение вируса в организм.Генетики объединяют усилияВ марте Андреа Ганна из Института молекулярной биологии Университета Хельсинки запустил проект по исследованию генетики пациентов с COVID-19 (COVID-19 Host Genetics Initiative). Сейчас к нему присоединились 158 научных коллективов со всего мира.

Одни анализируют открытые базы данных геномов, выявляя инфицированных, другие собирают образцы у пациентов в особенно пострадавших регионах. Компания Genotek — пока единственный российский участник — работает с уже имеющимися в ее распоряжении образцами ДНК.

“Мы предложили нашим клиентам, которые сдавали у нас генетические тесты, ответить на несколько вопросов — были ли они инфицированы коронавирусом, насколько сильно проявлялась болезнь, есть ли факторы риска, осложняющие ее течение. Мы планируем собрать порядка ста тысяч анкет.

Глобальная цель — научная публикация о генетической предрасположенности к коронавирусной инфекции у россиян”, — говорит генеральный директор Genotek Валерий Ильинский.Компания использует микрочипы, рекомендованные консорциумом COVID-19 Host Genetics Initiative.

[attention type=yellow]

Они позволяют прочитать одновременно 650 тысяч последовательностей в геноме — те, что изменчивы у более чем одного процента населения.”Мне не известно, чтобы кто-то исследовал достаточно образцов и сделал определенные выводы. Пока все сводится к умозрительным гипотезам без реальных экспериментов и проверки на статистическую значимость”, — подчеркивает Ильинский.

[/attention]

Ворота для инфекцииМеханизм проникновения в клетку коронавируса известен со времен эпидемии SARS. На липидной оболочке SARS-CoV-2 находятся белки-шипы, которые связываются с белками-рецепторами ACE2 на мембране клетки слизистой человека и используют их как ворота, чтобы внедриться в организм.

Логично предположить, что могут существовать мутации гена, кодирующего ACE2, усиливающие или, наоборот, ослабляющие действие вируса.Ученые из США, Канады, Индии и Сингапура проанализировали более 290 тысяч геномов людей из почти четырех сотен популяций и обнаружили несколько вариантов генов ACE2, которые влияют на его взаимодействие с белком-шипом.

Причем все эти мутации довольно редкие.Специалисты из Бельгии обратили внимание на фермент ACE1, который, как и ACE2, участвует в регуляции кровотока в сосудах. У носителя одного из вариантов гена ACE1 — аллеля D (с делецией с 16 интроне) — ACE2 не очень активен, белка вырабатывает меньше.

В результате белку-шипу на вирусной частице не с чем связываться, он не может проникнуть в клетку и у человека меньше шансов заразиться.

Анализ геномов жителей 25 стран Европы, Турции, Израиля показал, что в некоторых регионах носителей D-аллеля больше и там меньше заболевших, ниже смертность от COVID-19.

В Китае и Южной Корее, первыми пострадавших от эпидемии, D-аллель встречается редко.Генетический пазлЧтобы белок-шип на вирусной частице проник в организм, его нужно активировать. Это делает еще один фермент на мембране клетки человека — TMPRSS2, принадлежащий семейству сериновых протеаз (они расщепляют другие белки).

Ученые из Италии проанализировали 1025 вариантов гена, кодирующего TMPRSS2, в ДНК людей из 17 разных популяций. И хотя некоторые варианты нередки, значимых корреляций с числом заболевших не выявили.

[attention type=red]

Однако авторы работы полагают, что это, возможно, удастся для тех участков ДНК, которые регулируют активность данного гена, — так называемых экспрессий локусов количественных признаков (eQTL).

[/attention]

Недавний препринт индийских иследователей это подтвердил: найдены мутации, которые меняют работу генов для белка TMPRSS2 конкретно в легких и тем самым способствуют быстрому распространению в Европе и Северной Америке нового коронавируса подтипа A2a.

В то же время ученые из Орегонского университета медицины и науки в США указали на гены, контролирующие иммунную систему, в частности кодирующие лейкоцитарные антигены — HLA. Эти молекулы первыми цепляются к вирусной частице, распознают ее и сигнализируют т-клеткам: “это враг, убей”. Чем больше в крови HLA, тем сильнее иммунная система.Выяснилось, что некоторые типы HLA действуют эффективнее, обнаруживают больше вирусных частиц. Это значит, что есть какие-то мутации генов, кодирующих эти молекулы-сенсоры. Действительно, у больных коронавирусом чаще встречались аллели HLA B46:01 — они особенно плохо справлялись с распознаванием вируса.

В данных о геномах пациентов, сильно пострадавших от эпидемии SARS в 2002-2004 годы, тоже нашли эту мутацию.Скорее всего, мутация гена HLA — не единственная, увеличивающая риск тяжелого заболевания новой коронавирусной инфекцией, подчеркивают авторы работы, но она может быть важной частью этой проблемы.

https://ria.ru/20200508/1571147574.html

https://ria.ru/20200506/1571019905.html

https://ria.ru/20200429/1570682709.html

москва

сингапур (страна)

южная корея

сша

РИА Новости

Россия, Москва, Зубовский бульвар, 4

7 495 645-6601


https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/

2020

РИА Новости

Россия, Москва, Зубовский бульвар, 4

7 495 645-6601


https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/

Новости

ru-RU

https://ria.ru/docs/about/copyright.html

https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/

РИА Новости

Россия, Москва, Зубовский бульвар, 4

7 495 645-6601


https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/

https://cdn24.img.ria.ru/images/07e4/05/06/1571037864_131:0:2860:2047_1400x0_80_0_0_a2667414df7bd70995634fe9f6e14caa.jpg

РИА Новости

Россия, Москва, Зубовский бульвар, 4

7 495 645-6601


https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/

РИА Новости

Россия, Москва, Зубовский бульвар, 4

7 495 645-6601


https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/

коронавирус sars, коронавирус covid-19, genotek, генетика, биология, здоровье, открытия – риа наука, москва, сингапур (страна), южная корея, сша

МОСКВА, 13 мая — РИА Новости, Татьяна Пичугина. Коронавирус ведет себя избирательно: одни страны сильно страдают от эпидемии, в других ситуация более спокойная.

Многие люди переносят болезнь без симптомов, а кто-то попадает в реанимацию. Одно из объяснений — генетическая предрасположенность.

Не исключено, что в ДНК есть мутации, сдерживающие или, наоборот, облегчающие проникновение вируса в организм.

Генетики объединяют усилия

В марте Андреа Ганна из Института молекулярной биологии Университета Хельсинки запустил проект по исследованию генетики пациентов с COVID-19 (COVID-19 Host Genetics Initiative). Сейчас к нему присоединились 158 научных коллективов со всего мира.

Одни анализируют открытые базы данных геномов, выявляя инфицированных, другие собирают образцы у пациентов в особенно пострадавших регионах. Компания Genotek — пока единственный российский участник — работает с уже имеющимися в ее распоряжении образцами ДНК.

“Мы предложили нашим клиентам, которые сдавали у нас генетические тесты, ответить на несколько вопросов — были ли они инфицированы коронавирусом, насколько сильно проявлялась болезнь, есть ли факторы риска, осложняющие ее течение. Мы планируем собрать порядка ста тысяч анкет.

Глобальная цель — научная публикация о генетической предрасположенности к коронавирусной инфекции у россиян”, — говорит генеральный директор Genotek Валерий Ильинский.

Компания использует микрочипы, рекомендованные консорциумом COVID-19 Host Genetics Initiative. Они позволяют прочитать одновременно 650 тысяч последовательностей в геноме — те, что изменчивы у более чем одного процента населения.

“Мне не известно, чтобы кто-то исследовал достаточно образцов и сделал определенные выводы. Пока все сводится к умозрительным гипотезам без реальных экспериментов и проверки на статистическую значимость”, — подчеркивает Ильинский.

Ворота для инфекции

Механизм проникновения в клетку коронавируса известен со времен эпидемии SARS.

На липидной оболочке SARS-CoV-2 находятся белки-шипы, которые связываются с белками-рецепторами ACE2 на мембране клетки слизистой человека и используют их как ворота, чтобы внедриться в организм.

Логично предположить, что могут существовать мутации гена, кодирующего ACE2, усиливающие или, наоборот, ослабляющие действие вируса.

Ученые из США, Канады, Индии и Сингапура проанализировали более 290 тысяч геномов людей из почти четырех сотен популяций и обнаружили несколько вариантов генов ACE2, которые влияют на его взаимодействие с белком-шипом. Причем все эти мутации довольно редкие.

[attention type=green]

Специалисты из Бельгии обратили внимание на фермент ACE1, который, как и ACE2, участвует в регуляции кровотока в сосудах. У носителя одного из вариантов гена ACE1 — аллеля D (с делецией с 16 интроне) — ACE2 не очень активен, белка вырабатывает меньше.

[/attention]

В результате белку-шипу на вирусной частице не с чем связываться, он не может проникнуть в клетку и у человека меньше шансов заразиться.

Анализ геномов жителей 25 стран Европы, Турции, Израиля показал, что в некоторых регионах носителей D-аллеля больше и там меньше заболевших, ниже смертность от COVID-19.

В Китае и Южной Корее, первыми пострадавших от эпидемии, D-аллель встречается редко.

Генетический пазл

Чтобы белок-шип на вирусной частице проник в организм, его нужно активировать. Это делает еще один фермент на мембране клетки человека — TMPRSS2, принадлежащий семейству сериновых протеаз (они расщепляют другие белки).

Ученые из Италии проанализировали 1025 вариантов гена, кодирующего TMPRSS2, в ДНК людей из 17 разных популяций. И хотя некоторые варианты нередки, значимых корреляций с числом заболевших не выявили.

[attention type=red]

Однако авторы работы полагают, что это, возможно, удастся для тех участков ДНК, которые регулируют активность данного гена, — так называемых экспрессий локусов количественных признаков (eQTL).

[/attention]

Недавний препринт индийских иследователей это подтвердил: найдены мутации, которые меняют работу генов для белка TMPRSS2 конкретно в легких и тем самым способствуют быстрому распространению в Европе и Северной Америке нового коронавируса подтипа A2a.

В то же время ученые из Орегонского университета медицины и науки в США указали на гены, контролирующие иммунную систему, в частности кодирующие лейкоцитарные антигены — HLA. Эти молекулы первыми цепляются к вирусной частице, распознают ее и сигнализируют т-клеткам: “это враг, убей”. Чем больше в крови HLA, тем сильнее иммунная система.

Выяснилось, что некоторые типы HLA действуют эффективнее, обнаруживают больше вирусных частиц. Это значит, что есть какие-то мутации генов, кодирующих эти молекулы-сенсоры.

Действительно, у больных коронавирусом чаще встречались аллели HLA B46:01 — они особенно плохо справлялись с распознаванием вируса.

В данных о геномах пациентов, сильно пострадавших от эпидемии SARS в 2002-2004 годы, тоже нашли эту мутацию.

Скорее всего, мутация гена HLA — не единственная, увеличивающая риск тяжелого заболевания новой коронавирусной инфекцией, подчеркивают авторы работы, но она может быть важной частью этой проблемы.

Источник: https://ria.ru/20200513/1571223570.html

Лаборатория персонализированной геномной диагностики

Делеция не выявлена что это значит

Руководитель АБИЛЬДИНОВА ГУЛЬШАРА ЖУСУПОВНА

Врач-генетик высшей категории, доктор медицинских наук, профессор. Общий стаж работы – 29 лет, научно- педагогический – 26 лет.

Неоднократно проходила повышение квалификации в ведущих генетических центрах мира  (Израиль, Швейцария, Турция,  Россия), имеет международные сертификаты.

Является членом Международной Ассоциации цитогенетиков, мутагенеза, Российского общества медицинских генетиков.

СПИНАЛЬНАЯ АМИОТРОФИЯ ТИПЫ I, II, III, IV: ПОИСК ДЕЛЕЦИЙ В ГЕНЕ SMN1

Спинальная мышечная атрофия (СМА) или проксимальная спинальная амиотрофия – это наследственное заболевание, при котором происходит нарушение функции нервных клеток спинного мозга, приводящее к прогрессивному развитию слабости мышц, их атрофии, и в итоге, обездвиживанию пациента.

Каждый 35 человек является бессимптомным носителем мутации, приводящей к СМА, и больной ребенок рождается, когда встречаются 2 таких мутации, со стороны матери и со стороны отца.

Это происходит примерно 1 раз на 6 000 рождений – в семьях, где никто, как правило, не слышал про такую болезнь, где не было больных родственников, вредных факторов среды – ничего, что могло бы навести на мысль о высоком риске генетических проблем.

Причиной заболевания в большинстве случаев являются мутации в генах SMN1 и SMN2, находящихся в 5 хромосоме.

https://www.youtube.com/watch?v=7Cf7ER-AL3E

Поскольку это заболевание является наследственным, для постановки верного диагноза важно, чтобы врач-генетик подробно собрал семейный анамнез и назначил необходимое генетическое тестирование.

Важно! При подтверждении диагноза в семье необходимо провести генетическое обследование близких родственников пациента.

К сожалению, на сегодняшний день специфического лечения заболевания не существует. Возможна лишь симптоматическая терапия: физиотерапия, массаж и др.

Для семей, которые уже столкнулись с этим заболеванием и хотят в дальнейшем иметь здоровых детей, существует несколько вариантов профилактики: проведение пренатальной диагностики, использование донорской спермы и яйцеклеток, преимплантационная генетическая диагностика (ПГД). ПГД позволяет обследовать эмбрионы, полученные при ЭКО, еще до беременности и выбрать тот, что не унаследовал заболевание. Все больше семей в мире предпочитают именно такой формат профилактики.

УЗНАТЬ О РИСКЕ, НЕ ДОЖИДАЯСЬ РОЖДЕНИЯ БОЛЬНОГО РЕБЕНКА, МОЖНО с помощью генетического скрининга, разработанного лабораторией Больницы, на носительство мутаций, приводящих к СМА.

НАЗВАНИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ:

Молекулярно-генетическая диагностика методом MLPA крупных делеций/дубликаций в генах SMN1 и SMN2, ассоциированных со спинальной мышечной атрофией

Для чего используется исследование?

[attention type=yellow]

В соответствии с международными клиническими рекомендациями, генетическое обследование с целью определения крупных делеций/дупликаций в генах SMN1 и SMN2 проводится при наличии у пациента клинической симптоматики, характерной для данного заболевания, а также родственникам

[/attention]

– для верификации диагноза “спинальная мышечная атрофия” при наличии у пациента характерной клинической симптоматики;

– для оценки степени тяжести клинических проявлений и прогноза спинальной мышечной атрофии;

– для оценки риска рождения ребенка со спинальной мышечной атрофией или носительством ее генетической мутации.

Когда назначается исследование?

– При подозрении на спинальную мышечную атрофию Верднига-Гоффмана, Кугельбегера -Веландера на основе анамнеза и клинической симптоматики;

– при подозрении на спинальную мышечную амиотрофию,

– при дифференциальной диагностике болезни моторных нейронов;

– при дифференциальной диагностике мышечной слабости;

– при раннем выявлении заболевания у родственников;

– при планировании семьи – для оценки генетического риска для будущего ребенка.

Что означают результаты?

Референсные значения

Экзон 7 гена SMN1Обнаружено 2 копии 7 экзона гена SMN1
Экзон 8 гена SMN1Обнаружено 2 копии 8 экзона гена SMN1
Определение количества копий гена SMN2Количество копий гена SMN2 – 1 копия гена; Количество копий гена SMN2 – 2 копии гена; Количество копий гена SMN2 – 3 копии гена;Количество копий гена SMN2 – 4 копии гена

Если мутация определяется в обеих копиях гена (т.е. в обеих хромосомах), то это ведет к развитию спинальной мышечной атрофии.

Обнаружение нарушения в одной хромосоме свидетельствует о носительстве, заболевание при этом не возникает, но у двух носителей существует риск рождения детей с патологией.

Отсутствие мутации в обеих копиях гена свидетельствует об отсутствии риска развития спинальной мышечной атрофии и у самого человека, и у детей

Важные замечания

[attention type=green]

Для получения заключения по результату обследования необходимо проконсультироваться у врача-генетика.

[/attention]

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Венозную кровь

Как правильно подготовиться к исследованию?

Подготовка к исследованию не требуется

Стоимость исследования:

70 500 тенге

Определение мутации в гене DMD при миодистрофии Дюшенна/Беккераметодом MLPA

Миодистрофия Дюшенна/Беккера обусловлена мутацией в гене, кодирующем белок дистрофин (ген DMD).

Относится к наследственным заболеваниям с X-сцепленным рецессивным, им страдают 50% мальчиков, в то время как женщины могут быть носительницами повреждённого гена.

Примерно в 2/3 случаев сын получает хромосому с повреждением от матери-носительницы, в остальных случаях заболевание возникает в результате первичной мутации (de novo).

Ген DMD состоит из 79 экзонов. При мышечной дистрофии обнаруживаются мутации (чаще всего делеции) одного или нескольких экзонов гена, реже точковые мутации или дупликации. В данном исследовании анализируются мутации всех экзонов с 1 по 79.

Миодистрофия Дюшенна (МД) чаще всего проявляется в раннем возрасте 2-5 лет и характеризуется прогрессирующей мышечной слабостью, атрофией мышц, часто сопровождается кардиомиопатией и нарушением интеллекта.

[attention type=red]

На начальных этапах МД в основном поражаются проксимальные отделы мышечной системы (мышцы бедра, таза, плечевого пояса), но при последующей прогрессии затрагиваются все отделы мышечной системы.

[/attention]

Биохимическим маркером заболевания является повышенный (в 100-200 раз) уровень креатинфосфокиназы (КФК) в крови. У носительниц поврежденного гена уровень КФК также несколько повышен.  

НАЗВАНИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ:

Определение мутации в гене DMD при миодистрофии Дюшенна методом MLPA

Для чего используется исследование?

В соответствии с международными клиническими рекомендациями, генетическое обследование на миодистрофию Дюшенна/Беккера проводится при наличии у пациента клинической симптоматики, характерной для данного заболевания, а также родственникам и детям больного.

Когда назначается исследование?

– При подозрении на миодистрофию Дюшенна/Беккера;

– при дифференциальной диагностике мышечной слабости;

– при дифференциальной диагностике мышечных судорог и миоглобинурии;

– при раннем выявлении заболевания у родственников;

– при планировании семьи.

Что означают результаты?

Генетическое обследование является основным методом подтверждения диагноза и основано на выявлении делеции или дупликации одного или нескольких экзонов с помощью метода фрагментного анализа в гене DMD.

Нормальные значения: Патологических делеций и дупликаций экзонов 1-79 в гене DMD не обнаружено.

Положительный результат: Обнаружена делеция/дупликация в гене DMD. Диагноз “миодистрофия Дюшенна/Беккера” подтвержден.

Наличие мутации является молекулярно-генетическим подтверждением клинического диагноза миодистрофии Дюшенна/Беккера и позволяет проводить дородовую диагностику в семье.

Что может влиять на результат?

Ген DMD, ответственный за миодистрофию Дюшенна/Беккера, находится в локусе Xp21.2-p21.1 и состоит из 79 экзонов. В 60% случаев мутаций представляют собой протяжённые делеции (от одного до нескольких десятков экзонов), в 10% случаев – точковые мутации и в 30% – дупликации. При подозрении на точковую мутацию необходимо проведение экзомного секвенирования.

Важные замечания

[attention type=green]

Для получения заключения по результату обследования необходимо проконсультироваться у врача-генетика.

[/attention]

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Венозную кровь

Как правильно подготовиться к исследованию?

Подготовка к исследованию не требуется

Стоимость исследования:

70 500 тенге

За дополнительной информацией звоните по телефонам:

8 (7172) – 70 – 81 – 34

Слишком много хорошего может быть плохим

Анализ микробиома кишечника – это простой, неинвазивный и эффективный способ узнать, используя передовые технологии молекулярной генетики, сколько полезных бактерий у Вас в толстом кишечнике. Если считать по массе, то в теле взрослого человека [микробов] в среднем около полутора килограммов.

Это делает нашу микробиоту одним из самых крупных органов, который по весу соперничает с мозгом и лишь немногим уступает печени. Бактерии в желудочно-кишечном тракте, которые составляют микробиом кишечника, играют жизненно важную роль в вашей иммунной системе, функции щитовидной железы, здоровье костей и общем состоянии здоровья.

Сложная сеть лимфоидных клеток вместе с полезными бактериями в тонкой кишке помогают бороться с инфекциями и регулировать иммунную систему. Найденные здесь полезные бактерии также производят ключевые питательные вещества, такие как витамины и жирные кислоты.

 На самом деле было подсчитано, что до половины суточной нормы витамина К обеспечивается кишечными бактериями. Эти бактерии также помогают создать движение в толстой кишке для перемещения содержимого через кишечник.

 Однако, когда полезные микроорганимы размножаются до чисел, превышающих нормальные, или колонизируют тонкую кишку они питаются углеводами из нашей пищи, создавая избыток газа, вздутие живота и воспаление, которые влияют на усвоение нами питательных веществ.

Также анализ выявляет присутствие патогенных микроорганизмов, таких как дрожжи, паразиты и бактерии, которые способствуют хроническим заболеваниям и нарушениям пищеварения. К счастью, как только Вы начинаете контролировать и восстанавливать естественный баланс кишечника, Вы можете устранить эти расстраивающие пищеварительные симптомы.

Подходит ли исследование для Вас?

Человеческое тело – это безупречно спроектированная машина, созданная для того, чтобы функционировать определенным образом и разумно лечить себя.

 К сожалению, среднестатистический человек с самого раннего возраста постепенно отказывается от естественного замысла тела, питаясь неестественными продуктами, сидя весь день или живя в обстановке высокого стресса.

 Есть также лекарства, которые влияют или нарушают нормальную флору кишечника, такие как антибиотики, блокирующие кислоту лекарства и стероиды. Всё это привело к эпидемии хронических заболеваний в мире.

[attention type=yellow]

Не принимайте боль, усталость, неспособность сосредоточиться или ожирение как нормальные! Если Вы хотите чувствовать себя лучше, работать лучше и избавиться от зависимости от лекарств, Вам может помочь исследование микробиома кишечника.

[/attention]

Отчет о результатах исследования содержит полезную информацию о том, какие рецептурные и натуральные продукты наиболее эффективны против определенных штаммов организма, обнаруженных в образце стула. Здоровье кишечника – это окно в наше общее состояние здоровья, и этот передовой тест дает много информации о нашем кишечном микробиоме.

Благодаря составленным рекомендациям Вы сможете улучшить общее состояние кишечника и состояние иммунной функции кишечника.

Уважаемые пациенты! Теперь у вас есть возможность получить заключение квалифицированного врача-генетика по результатам генетических исследований.

Заключение врача-генетика включает объяснение значения выявленного энтеротипа, возможные патогенетические механизмы, связанные с развитием тех или иных состояний, индивидуальные риски развития патологических состояний и рекомендации по предотвращению, диагностике и возможным подходам ведения пациента.

Исследование на микробиом и консультация у нашей команды врачей, медицинских генетиков, гастроэнтерологов и диетологов может направить Вас на путь к оптимальному здоровью и хорошему самочувствию!

Кишечные бактерии говорят нам как правильно питаться!

Необходимые исследования:

Молекулярно-генетическая оценка соотношений микроорганизмов (микробиома) человека

Исследуемый материал:

Кал, собранный в стерильный пластиковый контейнер.

Подготовка к исследованию:

За сутки до сдачи анализа ограничить прием растительной пищи

Стоимость исследования:

167 000 тенге

За дополнительной информацией звоните по телефонам:

8 (7172) – 70 – 81 – 34

Источник: https://bmcudp.kz/ru/about/diagnostic/6762

Субтеломерные делеции 1q43q44 и тяжелые поражения головного мозга, связанные с задержкой миелинизации | журнал генетики человека

Делеция не выявлена что это значит

  • перегласовка
  • Миелин биология и ремонт
  • Нарушения развития нервной системы

Субтеломерные делеции 1q44 вызывают задержку умственного развития, задержку развития и аномалии головного мозга, в том числе аномалии мозолистого тела (ACC) и микроцефалию у большинства пациентов.

Мы сообщаем о случаях шести пациентов с делециями 1q44; два пациента с интерстициальными делециями 1q44; и четыре пациента с терминальными делециями 1q. У одного из пациентов наблюдалась несбалансированная транслокация между хромосомой 5.

Все области делеции перекрывались с ранее сообщенными критическими областями для ACC, микроцефалии и судорог, что указывает на рецидивную природу основных фенотипических признаков делеций 1q44.

У четырех пациентов с терминальными делециями 1q обнаружена сильная потеря объема в мозге по сравнению с пациентами, у которых были интерстициальные делеции 1q44. Это указывало на то, что теломерные области играют важную роль в серьезной потере объема мозга.

Кроме того, у двух пациентов с терминальными делециями 1q43, за пределами критической области для синдрома делеции 1q44, наблюдалась отсроченная миелинизация. Поскольку области делеции, идентифицированные у этих пациентов, расширяются к центромере, мы заключаем, что гены, ответственные за задержанную миелинизацию, могут быть расположены в соседней области 1q43.

Субмикроскопические субтеломерные хромосомные делеции были обнаружены у 7, 4% детей с умственной отсталостью от умеренной до тяжелой степени. 1 Некоторые субтеломерные делеционные синдромы являются клинически узнаваемыми и идентифицируются по характерным признакам, тогда как некоторые другие не могут быть идентифицированы с помощью таких средств.

Недавнее развитие молекулярного кариотипирования с использованием хромосомных микрочипов выявило четкие корреляции генотип-фенотип и выявило критические хромосомные области с характерными признаками субтеломерных делеций. Наиболее ярким примером является синдром Миллера-Дикера, который показал четкие корреляции генотип-фенотип.

[attention type=red]

2 Синдром Миллера-Дикера вызывается субтеломерной делецией 17p и хорошо распознается и характеризуется лиссэнцефалией и отличительными чертами лица 3, которые являются результатом участия гена регуляторной субъединицы 1 фактора активации тромбоцитов 1b ( PAFAH1B1 ) и тирозина Ген 3-монооксигеназы / триптофана 5-монооксигеназы-активирующий эпсилон-полипептидный ген ( YWHAE ) соответственно; оба эти гена расположены на 17p13. 3

[/attention]

Несколько исследований исследовали критическую область для синдрома субтеломерной делеции 1q44 и обнаружили, что основными фенотипическими признаками синдрома субтеломерной делеции 1q44 являются микроцефалия, аномалии мозолистого тела (ACC) и судороги. 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16 Недавно Ballif et al. 17 проанализировали пациентов с микроделециями 1q44 и предложили определенные гены, которые могут отвечать за индивидуальные особенности.

Мы сообщаем о случаях шести вновь выявленных пациентов с делециями 1q44; два с интерстициальной делецией 1q44; и четыре с удалением терминала 1q. Поскольку у пациентов с терминальной делецией 1q44 обнаружены более тяжелые фенотипы по сравнению с пациентами с интерстициальной делецией, фенотипические различия будут получены из дополнительно удаленной области 1q43q44.

Хромосомные делеции

Тестирование хромосомных микрочипов выявило аберрации в области 1q43q44 у шести пациентов (рис. 1). У пациентов 1 и 2 были удалены интерстициальные делеции 1, 9 и 2, 2 Мб, соответственно, в области 1q43q44. У пациента 1 анализ FISH подтвердил удаление (рис. 2а).

Последующий анализ FISH не выявил аномалий у родителей обеих семей, что указывает на делеции de novo у обоих пациентов.

Молекулярное кариотипирование определяло аберрации как arr 1q44 (243 809 193–245 665 521) × 1 дн для пациента 1 и arr 1q43q44 (243 303 991–245 506 920) × 1 дн для пациента 2.

Результаты тестирования хромосомных микрочипов, представленные в Gene View Agilent Genomic Workbench (Agilent Technologies). Вертикальная ось и горизонтальная ось представляют отношение сигналов log 2 и геномное положение соответственно. Аберрантные области показаны синими прямоугольниками. Точки указывают положения генома и отношение log 2 каждого зонда.

Изображение в полном размере

Результаты анализов FISH. ( a ) Потеря зеленой маркировки сигнала RP11-7L23 (стрелка) указывает на удаление 1q44 у пациента 1. ( b ) Потеря зеленой маркировки сигнала RP11-88N11 (стрелка) указывает на удаление 1q44 у пациента 3.

( ce ) Подтверждение несбалансированной транслокации между хромосомой 1 и 5 у пациента 4. Потеря зеленой маркировки сигнала RP11-143E8 (стрелка) указывает на делецию 1q44 ( c ). Дополнительная сигнальная метка RP11-94J21 5p15.

33 присутствует на другой хромосоме ( d, красный сигнал, стрелка), что указывает на транслокацию на хромосому 1 ( e, зеленый сигнал, стрелка).

Изображение в полном размере

У пациента 3 терминальные делеции 1q43 были идентифицированы и подтверждены с помощью анализа FISH (рис. 2b). Поскольку анализ FISH для обоих родителей не выявил никаких отклонений, эта делеция произошла как de novo . Молекулярное кариотипирование пациента 3 было обозначено как обр 1q43q44 (242 442 098–249 250 621) × 1 дн.

[attention type=green]

У пациента 4 была выявлена ​​потеря числа копий генома в 1q43q44 и дополнительное усиление в 5p15.33 (дополнительная фигура 1). Последующий анализ FISH подтвердил несбалансированную транслокацию между 1q43 и 5p у пациента 4 (Рисунки 2c-e), и ни у одного из родителей транслокация не была обнаружена.

[/attention]

Следовательно, было установлено, что транслокация дисбаланса у пациента была de novo по происхождению. Ее кариотип был 46, XX, дер (1) т (1; 5) (q43; с15, 33) .arr 1q43q44 (242 223 230–249 212 668) × 1, 5p15, 33 (57 640–1 705 515) × 3 дн.

Дублированная область 5p была только 1, 7 Мб из терминальной области.

У пациента 5 терминальные делеции 1q43 были идентифицированы с точкой разрыва в гене гомолога 3 вирусного онкогена v-akt мышиной тимомы ( AKT3 ). Молекулярный кариотип был arr 1q44 (243 880 099–249 212 668) × 1. Наибольшая делеция была выявлена ​​у пациента 6 с arr 1q43q44 (238 888 870–249 212 668) × 1.

Результаты анализа FISH приведены в дополнительной таблице 1.

Клинический отчет

9-летний мальчик родился вакуумной экстракцией. Его масса тела при рождении составляла 2820 г (в пределах 25-го центиля), длина составляла 45 см (= 3-й центиль), а окружность затылочно-лобного отдела тела (OFC) составляла 32, 5 см (10-25-й центиль).

После рождения у него появились проблемы с кормлением. Его развитие было слегка задержано: контроль над головой был достигнут через 8 месяцев, сидя без поддержки в 15 месяцев, ползая через 24 месяца и ходя в одиночестве без поддержки через 44 месяца.

В возрасте 11 месяцев он перенес рецидив фебрильных судорог. В 18 месяцев он перенес нефебрильные судороги.

Магнитно-резонансная томография головного мозга (МРТ) в возрасте 4 лет показала потерю объема в лобной доле, легкие аномальные формы гираля в лобной доле и боковой доле, а также ACC (Рисунки 3a – c). Обычный хромосомный анализ выявил нормальный мужской кариотип.

Результаты МРТ головного мозга пациента 1, осмотренного в 4 года ( ac ), пациента 2, осмотренного в 3 года ( df ), пациента 3, осмотренного в 12 месяцев ( gi ), пациента 4, осмотренного в 15 месяцев ( j1 ) пациент 5 обследован через 5 месяцев ( м- о ), а пациент 6 обследован через 3 года ( р- р ). T1-взвешенные сагиттальные виды ( a, d, g, j, m, p ), T1-взвешенные осевые виды ( b, e, h, k, n, q ) и T2-взвешенные осевые виды ( c, f, i, l, o, r ). АКК отмечены у всех пациентов. Пациент 5 ( м ), в частности, демонстрирует полный агенез мозолистого тела. Уменьшение объема лобной доли наблюдается у всех пациентов. Заметно отсроченная миелинизация отмечена у пациентов 3 и 4 ( i и l ).

Изображение в полном размере

В настоящее время его рост составляет 119, 5 см (

Источник: https://ru.ovalengineering.com/subtelomeric-deletions-1q43q44-251836

Будь здоров
Добавить комментарий

;-) :| :x :twisted: :smile: :shock: :sad: :roll: :razz: :oops: :o :mrgreen: :lol: :idea: :grin: :evil: :cry: :cool: :arrow: :???: :?: :!: